7 сентября 2007 года образован Следственный комитет при прокуратуре РФ. 15 января 2011 года Указом Президента Следственный комитет при прокуратуре РФ преобразован в самостоятельный орган.
Своей деятельностью сотрудники следственного управления Следственного комитета РФ по Республике Марий Эл вносят весомый вклад в укрепление законности и правопорядка. За 8 месяцев 2018 года следователями следственного управления Следственного комитета РФ по Республике Марий Эл проведены проверки по 1739 сообщениям о преступлениях, расследовано 425 уголовных дел.